Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DESP17661 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DESP17661 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 867.7 ms