Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPA3P15088 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPA3P15088 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPA3P15088 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms