Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNAP12004 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNAP12004 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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