Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCF2P10911 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCF2P10911 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCF2P10911 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms