Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms