Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPBP07199 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPBP07199 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPBP07199 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms