Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDN1P05305 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDN1P05305 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDN1P05305 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDN1P05305 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EDN1P05305 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDN1P05305 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDN1P05305 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDN1P05305 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDN1P05305 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDN1P05305 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDN1P05305 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDN1P05305 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDN1P05305 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDN1P05305 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms