Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYBBP04839 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYBBP04839 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYBBP04839 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms