Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3DO95025 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3DO95025 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3DO95025 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3DO95025 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3DO95025 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3DO95025 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3DO95025 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3DO95025 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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SEMA3DO95025 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3DO95025 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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