Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS11DO60235 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms