Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LDB2O43679 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LDB2O43679 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LDB2O43679 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LDB2O43679 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDB2O43679 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDB2O43679 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDB2O43679 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDB2O43679 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDB2O43679 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms