Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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HOXA3O43365 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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