Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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