Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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