Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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