Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTLL13PA6NNM8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTLL13PA6NNM8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTLL13PA6NNM8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTLL13PA6NNM8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms