Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms