Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PRAMEF25A6NGN4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PRAMEF25A6NGN4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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