Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms