Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM149AA5PLN7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM149AA5PLN7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms