Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTMR11A4FU01 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms