Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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