Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms