Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms