Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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RNF7Q9UBF6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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