Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A7Q9P2U7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms