Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHPF2Q9P2E5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms