Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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