Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP4Q9P0V3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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