Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms