Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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