Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms