Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf42Q9NWW7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms