Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms