Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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