Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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