Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms