Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms