Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms