Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms