Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms