Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB6Q9BUF5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB6Q9BUF5 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB6Q9BUF5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB6Q9BUF5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB6Q9BUF5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB6Q9BUF5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB6Q9BUF5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms