Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSL1

UBAC1, Ubiquitin-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAC1Q9BSL1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms