Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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