Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms