Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms