Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms