Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF34Q969K3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms