Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms