Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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FAM71DQ8N9W8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM71DQ8N9W8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM71DQ8N9W8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM71DQ8N9W8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM71DQ8N9W8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM71DQ8N9W8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM71DQ8N9W8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM71DQ8N9W8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM71DQ8N9W8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FAM71DQ8N9W8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FAM71DQ8N9W8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FAM71DQ8N9W8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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